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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

我国工业经济总体回稳向好******

　　光明日报北京1月11日电 记者刘坤从11日在京举行的全国工业和信息化工作会议获悉，2022年，我国工业经济总体回稳向好，预计全年规模以上工业增加值同比增长3.6%，其中制造业增加值增长3.1%左右。重点领域创新取得新突破，我国产业链供应链韧性和安全水平持续提升。

　　2022年，C919大型客机实现全球首架交付，国产10万吨级大型渔业养殖工船成功交付，腹腔镜手术机器人等高端医疗装备填补国内空白，国产四人雪车等冰雪装备实现“零”的突破，中国空间站全面建成，第三艘航母“福建舰”下水。重点产业链强链补链有序开展，实施一批产业基础再造工程项目。中小企业高质量发展取得新进展，累计培育专精特新中小企业7万多家、“小巨人”企业8997家、制造业单项冠军企业1186家。制造业高端化智能化绿色化发展步伐加快，传统产业加快改造提升。信息通信业快速发展，累计建成开通5G基站超过230万个，新型数据中心建设成效明显，中小微企业宽带和专线平均资费降低超过10%。

　　会议强调，2023年，要全力促进工业经济平稳增长；扎实推进“十四五”规划落地见效；提升重点产业链自主可控能力，“一链一策”推进强链补链稳链；深入推进产业基础再造；加快推进重大技术装备攻关；加快改造提升传统制造业；培育壮大新兴产业；加快信息通信业发展，加快5G和千兆光网建设，启动“宽带边疆”建设，全面推进6G技术研发；促进中小企业发展；优化国防科技工业体系和布局，建设先进国防科技工业，巩固一体化的国家战略体系和能力；支持部属高校“双一流”建设；提升行业治理能力；全力以赴做好重点医疗物资生产保供。

　　《光明日报》（ 2023年01月12日 10版）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）